Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX58O95786 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX58O95786 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX58O95786 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX58O95786 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX58O95786 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX58O95786 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms