Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FLOT1O75955 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLOT1O75955 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms