Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F6O75461 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F6O75461 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms