Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX3O75364 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms