Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAK2O60296 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms