Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP9BO43861 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP9BO43861 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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