Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTH3O43739 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms