Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRTM2O43300 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms