Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPATO15228 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPATO15228 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPATO15228 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPATO15228 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNPATO15228 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNPATO15228 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPATO15228 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms