Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms