Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC01387J3KSC0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC01387J3KSC0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms