Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms