Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPB9F8W1W9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB9F8W1W9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms