Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PMD0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PMD0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PMD0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PMD0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PMD0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PMD0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E9PMD0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms