Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATL2C9JE40 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATL2C9JE40 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms