Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C5orf58C9J3I9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C5orf58C9J3I9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms