Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVV-1B6SEH8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms