Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSPB2A8KAH6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSPB2A8KAH6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms