Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA5

DRGX, Dorsal root ganglia homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DRGXA6NNA5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DRGXA6NNA5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DRGXA6NNA5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms