Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms