Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CFAP73A6NFT4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CFAP73A6NFT4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms