Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms