Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms