Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POTEFA5A3E0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms