Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MTMR11A4FU01 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms