Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC144AA2RUR9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC144AA2RUR9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC144AA2RUR9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms