Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms