Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TGFBR1P36897 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms