Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
HOXA13P31271 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms