Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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