Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
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