Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F1Q01094 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms