Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ACADSBP45954 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms