Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
COL24A1Q17RW2 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms