Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms