Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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COL4A6Q14031 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
COL4A6Q14031 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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