Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTPRMP28827 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTPRMP28827 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTPRMP28827 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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PTPRMP28827 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPRMP28827 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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PTPRMP28827 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
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