Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYN1P17600 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYN1P17600 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms