Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IMPG1Q17R60 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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