Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IRF4Q15306 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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