Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC106706.1-201ENST00000439479 556 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA5P3-201ENST00000449348 345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SMIM10L2B-AS1-201ENST00000453528 1027 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP001024.1-201ENST00000474540 345 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AK4P2-201ENST00000504372 670 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TRMT112P1-201ENST00000505515 351 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPA1P65-201ENST00000508873 954 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC034206.1-202ENST00000514446 634 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ABCA3-205ENST00000567910 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC008569.1-201ENST00000590626 252 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC008770.1-208ENST00000591838 430 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 VDAC3P1-201ENST00000604654 850 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC117498.3-201ENST00000605409 511 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 BX005132.2-201ENST00000641254 464 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNF185-201ENST00000266252 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC02362-203ENST00000617323 2044 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP4S1-201ENST00000216366 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NME6-214ENST00000452211 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PHC1-214ENST00000544916 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL513122.1-201ENST00000455437 1463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GDPD2-202ENST00000453994 2438 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ILK-210ENST00000528995 1559 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CELF2-201ENST00000354897 1754 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC24A1-201ENST00000261892 5768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF608-210ENST00000613878 3190 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC008060.4-201ENST00000569431 1861 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PPFIBP2-224ENST00000533792 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DHX35-202ENST00000373323 2347 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC35F4-203ENST00000554729 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF35-203ENST00000399560 564 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP001888.1-201ENST00000413963 720 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC016027.3-201ENST00000429618 361 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC104333.3-201ENST00000449334 479 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL415P-201ENST00000490790 289 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL127P-201ENST00000494856 300 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CKLF-CMTM1-201ENST00000527729 585 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP000763.1-201ENST00000539481 325 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC027288.3-203ENST00000553165 448 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC132938.1-201ENST00000566971 360 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC01177-201ENST00000568030 536 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SUPT4H1-204ENST00000580947 574 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC012572.1-201ENST00000581634 397 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC005828.4-201ENST00000584608 552 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TMEM147-AS1-204ENST00000590125 698 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF561-AS1-206ENST00000591056 551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PROX1-AS1-208ENST00000601335 691 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CALCR-201ENST00000359558 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL035681.1-201ENST00000441316 2500 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms