Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CCDC142Q17RM4 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms