Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC023824.7-201ENST00000623041 5731 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CDY4P-201ENST00000418290 1513 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 MMAA-201ENST00000281317 7068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HERC1Q15751 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF322-201ENST00000415922 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CCDC18-201ENST00000343253 4867 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms