Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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