Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PTCH1Q13635 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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PTCH1Q13635 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTCH1Q13635 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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