Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SCN4AP35499 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SCN4AP35499 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms