Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AUP1Q9Y679 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AUP1Q9Y679 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms