Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms