Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP3Q9Y2W1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP3Q9Y2W1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms