Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LEMD3Q9Y2U8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms